華雅旗下紅榮微再授權(quán)代理TAKARA Rubicon 文庫構(gòu)建（illumina平臺）產(chǎn)品

Rubicon ThruPLEX® Plasma-seq Kit

ThruPLEX與所有Illumina平臺兼容

產(chǎn)品英文名稱：ThruPLEX® Plasma-seq Kit

產(chǎn)品中文名稱：血漿來源cell free DNA NGS文庫構(gòu)建試劑

樣本：血漿來源的cfDNA（cell free DNA）和ctDNA（循環(huán)腫瘤DNA）

用途：WGS，WES，靶向測序，ctDNA分析

ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技術(shù)，并用于血漿來源cfDNA高品質(zhì)NGS文庫（illumina平臺）構(gòu)建。

該試劑專門針對cell-free DNA進(jìn)行優(yōu)化，在保持樣本GC代表性的基礎(chǔ)上，提升了文庫的信息容量。文庫構(gòu)建后可用于CNV分析、全基因組測序分析或是采用一些panel針對目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行捕獲富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。

血漿樣品采用ThruPLEX Plasma-seq試劑盒制備文庫，能有更好的靈敏度、更準(zhǔn)確的基因變異分析結(jié)果。與其它液體活檢的樣品一樣，血漿由于其易獲得、價值高的特點，深受研究腫瘤學(xué)或者孕婦血漿中胎兒游離DNA科研工作者的重視。

產(chǎn)品特點

專為cfDNA設(shè)計：修復(fù)及連接試劑配方更新，方法優(yōu)化

高品質(zhì)NGS文庫：在寬廣的GC含量范圍內(nèi)，可以達(dá)到高檢測再現(xiàn)性

起始量范圍廣：＜1 ng到30 ng cfDNA量

快速簡便：單管、2小時、3步操作步驟，無需純化或樣品轉(zhuǎn)移步驟

應(yīng)用領(lǐng)域：液體活檢、ctDNA、靶向測序等領(lǐng)域文庫構(gòu)建

兼容自動化平臺：Beckman® FXP Workstation

ThruPLEX與所有Illumina平臺兼容

Designed for cell-free DNA: newly formulated repair and ligation reagents with optimized protocols

High performance NGS libraries: high diversity with broad and reproducible GC coverage

Variable sample input: <1 ng to 30 ng of cell-free DNA

Fast and simple workflow: 3 steps in a single tube or well in 2 hours with no purification or sample transfer steps

Research applications: libraries from samples where results require high sensitivity including liquid biopsies, ctDNA, and targeted sequencing

Automation-friendly: Beckman® FXP Workstation

產(chǎn)品應(yīng)用

WGS，WES，靶向測序，ctDNA分析

cfDNA文庫構(gòu)建，腫瘤及產(chǎn)前無創(chuàng)檢測（母體血漿中胎兒游離DNA分析）

ThruPLEX Plasma-seq 優(yōu)化用于cell-free DNA等液體活檢樣品

液體活檢樣品包括

循環(huán)核酸

– Cell-free DNA (cfDNA)

• 循環(huán)腫瘤DNA（ctDNA）占一小部分

及RNA 外泌體等

ThruPLEX技術(shù)原理

ThruPLEX技術(shù)和所有Illumina NGS平臺兼容。

技術(shù)要點：莖環(huán)形接頭

莖環(huán)形接頭的特別設(shè)計，免去了大多數(shù)Illumina等文庫制備技術(shù)需要的中間純化和樣品轉(zhuǎn)移步驟。整個實驗只需15分鐘手動操作且為1個反應(yīng)管、2個小時、3步反應(yīng)的簡單過程。僅在PCR反應(yīng)后進(jìn)行1次磁珠純化，純化造成的樣品損失低，可對珍貴樣品進(jìn)行有效分析。

產(chǎn)品使用

適用樣本：液體活檢樣本

1ng-30ng 血漿、尿液來源的cfDNA

組份 

分模板準(zhǔn)備、文庫合成和文庫擴(kuò)增三大部分。保存-20℃。

Template Preparation Buffer 模板準(zhǔn)備緩沖液（紅色）

Template Preparation Enzyme 模板準(zhǔn)備酶（紅色）

Library Synthesis Buffer文庫合成緩沖液（黃色）

Library Synthesis Enzyme文庫合成酶（黃色）

Library Amplification Buffer文庫擴(kuò)增緩沖液（綠色）

Library Amplification Enzyme文庫擴(kuò)增酶（綠色）

Nuclease-Free water 無核酸酶水（無色）

Indexing 試劑（藍(lán)色）

咨詢 1500 1904 520 紅榮微再-客服: 經(jīng)銷商專員

自備材料：

PCR管或96孔PCR板和密封件

Low binding aerosol barrier tips

新鮮制備的80％（v / v）乙醇

Agencourt® AMPure® XP 磁珠（Beckman Coulter，目錄號A63880）

可選試劑：

KAPA®Library Quantification Kit – Illumina (Kapa Biosystems, CAT. NO. specific to real time PCR system used)

EvaGreen® Dye (20X in water, Biotium, CAT. NO. 31000-T)

Fluorescein Calibration Dye (Bio-Rad Laboratories

簡單的工作流程：一管反應(yīng)

樣品加入PCR管。

準(zhǔn)備模版修復(fù)混合液1（紅蓋），加入PCR管，反應(yīng)。

準(zhǔn)備文庫合成混合液2（黃蓋），加入PCR管，反應(yīng)。

準(zhǔn)備文庫擴(kuò)增混合液3（綠蓋），加入PCR管，反應(yīng)。

產(chǎn)品性能

高cell-free DNA文庫多樣性、更少的Unmapped Reads。ThruPLEX Plasma-seq Kit構(gòu)建的文庫，具有高的多樣性和低的duplicates和unmapped reads。圖中表示cfDNA分別提取于3份血漿樣品，文庫定量采用Qubit熒光定量。Bioanalyzer測定mononucleosomal DNA在各樣品的量分別為0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。Pooled libraries采用illumina NextSeq 500 paired end模式測序，且每個文庫產(chǎn)生17 M到25 M reads。每個文庫在down-sampling數(shù)據(jù)至17 M reads以后，計算Duplication rates。

Rubicon R400490/R400491/R400492 訂購信息

Rubicon公司成立于2000年，總部位于美國密歇根州。產(chǎn)品都擁有技術(shù)，檢控嚴(yán)格，擁有cGMP級生產(chǎn)能力，是單細(xì)胞測序文庫構(gòu)建的。2017年1月，Rubicon 成為Takara的一員，并且發(fā)展良好。

華雅再生醫(yī)學(xué)旗艦公司：紅榮微再（上海）生物工程技術(shù)有限公司主營細(xì)胞治療和精準(zhǔn)醫(yī)療等產(chǎn)品，2018年與TAKARA繼續(xù)合作，授權(quán)代理（上海）其旗下Rubicon單細(xì)胞文庫構(gòu)建試劑等產(chǎn)品。