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Rubicon ThruPLEX Tag-seq Kit 測(cè)序文庫(kù)

簡(jiǎn)要描述:Rubicon ThruPLEX Tag-seq Kit 測(cè)序文庫(kù)
ThruPLEX Tag-seq采用帶有特別分子標(biāo)簽(UMT)的ThruPLEX引物構(gòu)建帶有分子標(biāo)記和樣品檢索引物的Illumina NGS文庫(kù)。

  • 產(chǎn)品型號(hào):R400584 R400585 R400586
  • 廠商性質(zhì):生產(chǎn)廠家
  • 更新時(shí)間:2019-03-29
  • 訪  問  量:1158
詳細(xì)介紹
供貨周期一個(gè)月以上

Rubicon ThruPLEX Tag-seq Kit 測(cè)序文庫(kù)

品牌                         貨號(hào)              名稱                                           規(guī)格      

Rubicon Genomics   R400584   ThruPLEX Tag-seq 6S(12)Kit    12Rxns

Rubicon Genomics   R400585   ThruPLEX Tag-seq 48S Kit             48Rxns 

Rubicon Genomics   R400586   ThruPLEX Tag-seq 96D Kit            96Rxns 

歡迎您致電 華雅再生醫(yī)學(xué)旗艦公司:紅榮微再(上海)生物工程技術(shù)有限公司 181 6644 1624。紅榮微再-客服 1022 355 724  

構(gòu)建帶有UMT(Unique Molecular Tags)的Illumina NGS文庫(kù)

ThruPLEX® Tag-seq Kit

· 可信賴的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。ThruPLEX Tag-seq 技術(shù)提供了多達(dá)1,600萬(wàn)個(gè)分子標(biāo)簽來糾正測(cè)序誤差,

   提供可信的變異檢測(cè)分析。

· 發(fā)現(xiàn)更多,成本更低。結(jié)合基于雜交技術(shù)的目標(biāo)序列富集系統(tǒng)可分析數(shù)百個(gè)基因,同時(shí)分析突變和

   結(jié)構(gòu)變異。

· 每次都可獲得高質(zhì)量文庫(kù)。單管操作,2小時(shí),3步操作流程。使用簡(jiǎn)便,可減少使用者操作誤差和

   污染發(fā)生。

· 省時(shí)的生物信息學(xué)分析方案。采用Curio Genomics提供的云服務(wù)軟件或開源軟件可以快速獲得

   研究結(jié)果。

· 珍貴樣品分析成為可能。更低的DNA起始量,以往由于起始量太低而不能分析的樣品也可以分析了。

   ThruPLEX Tag-seq可以1 ng至50 ng cfDNA或片段化的dsDNA起始,兼容多種樣品類型。

 

■ 產(chǎn)品說明:

ThruPLEX Tag-seq采用帶有特別分子標(biāo)簽(UMT)的ThruPLEX引物構(gòu)建帶有分子標(biāo)記和樣品檢索引物的Illumina NGS文庫(kù)。每個(gè)試劑盒包含超過1,600萬(wàn)個(gè)特別序列用于在擴(kuò)增前標(biāo)記每條DNA的片段,可以在文庫(kù)制備、目標(biāo)富集和數(shù)據(jù)分析過程中追蹤DNA的片段,以檢測(cè)低豐度等位基因或計(jì)數(shù)獨(dú)立片段。采用ThruPLEX 技術(shù)設(shè)計(jì)及優(yōu)化,可以1到50 ng DNA起始構(gòu)建高多樣性、高重復(fù)性文庫(kù)。整個(gè)流程在單管或單孔中就可完成,只需3步,2小時(shí),無(wú)需中間純化步驟和樣品轉(zhuǎn)移,避免了操作誤差和樣品損失。ThruPLEX Tag-seq Kit 包含所需全部試劑,包括可以多重標(biāo)記96個(gè)樣品的檢索引物。純化和定量后,文庫(kù)可以采用標(biāo)準(zhǔn)Illumina測(cè)序試劑和流程在Illumina NGS平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序。

 

 

 

圖1. 單管,三步操作流程。 ThruPLEX Tag-seq Kit以1-50 ng DNA起始構(gòu)建檢索引物文庫(kù)只需3步:末端修復(fù),接頭連接和高保真文庫(kù)擴(kuò)增。無(wú)需純化和樣品轉(zhuǎn)移步驟。簡(jiǎn)化的工作流程,在單管或單孔中2個(gè)小時(shí)即可完成,避免樣品損失,增強(qiáng)了陽(yáng)性識(shí)別。

 

 

 

圖2. ThruPLEX DNA-seq Kit技術(shù)概要。ThruPLEX技術(shù)以片段化雙鏈DNA或游離DNA起始,只需3步反應(yīng),簡(jiǎn)單高效。

 

 

 

 

圖3. 減少背景,結(jié)果更可靠。以30 ng 1% Horizon cfDNA standard,采用 ThruPLEX Tag-seq構(gòu)建文庫(kù)。Agilent SureSelect富集目標(biāo)區(qū)域,~5,000X覆蓋度測(cè)序,采用Curio Genomics生物信息學(xué)平臺(tái)分析數(shù)據(jù)。采用原始數(shù)據(jù)分析,EGFR 的突變(黃色點(diǎn))會(huì)被背景誤差遮蓋(左圖)。而在數(shù)據(jù)分析過程中使用UMT修正誤差,突變更容易識(shí)別(右圖)。

 

 

 

圖4. 顯著提高信噪比,發(fā)現(xiàn)更多。以30 ng(A)或10 ng Horizon cfDNA standard采用ThruPLEX Tag-seq構(gòu)建文庫(kù),240 KB定制panel(NimbleGen SeqCapEZ)富集目標(biāo)區(qū)域,HiSeq 2500 ~5,000X覆蓋度測(cè)序。Curio Genomics生物信息學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。

*數(shù)據(jù)來源于Takara Bio Inc.

Rubicon ThruPLEX Tag-seq Kit 測(cè)序文庫(kù)

 

■ 產(chǎn)品組成

· Template Preparation Buffer (Red)模板準(zhǔn)備緩沖液(紅色)

· Template Preparation Enzyme (Red)模板準(zhǔn)備酶(紅色)

· Library Synthesis Buffer (Yellow)文庫(kù)合成緩沖液(黃色)

· Library Synthesis Enzyme (Yellow)文庫(kù)合成酶(黃色)

· Library Amplification Buffer(Green)文庫(kù)擴(kuò)增緩沖液(綠色)

· Library Amplification Enzyme(Green)文庫(kù)擴(kuò)增(綠色)

· Nuclease-Free Water(Clear)無(wú)核酸酶水

· Indexing Reagent試劑(藍(lán)色

 

自備試劑:

熱循環(huán)儀(推薦使用實(shí)時(shí)儀器)

離心分離機(jī)

PCR管或96孔PCR板和密封件

低吸附濾芯槍頭

新鮮制備的80%(v / v)乙醇

Agencourt®XP核酸純化磁珠(Beckman Coulter,目錄號(hào)A63880)

 

■ 保存

-20℃

 

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