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產(chǎn)品中心

TruSeq Stranded mRNA文庫制備(48樣本)測序

  • 型   號:20020594(ssv21106)
  • 價   格:

TruSeq Stranded mRNA文庫制備(48樣本)測序
先前稱為TruSeq Stranded mRNA文庫制備試劑盒(目錄號RS-122-2101,RS-122-2102和RS-122-2103)的產(chǎn)物現(xiàn)稱為TruSeq Stranded mRNA。產(chǎn)品配置已更改。在新配置中,庫準(zhǔn)備和索引適配器可以單獨(dú)購買。

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產(chǎn)品名稱:TruSeq Stranded mRNA Library Prep (48 Samples)

附推廣RNA相關(guān)產(chǎn)品,如有需求,請在推文中查詢;更多產(chǎn)品,歡迎咨詢)

產(chǎn)品貨號:20020594(ssv21106)

產(chǎn)品規(guī)格:

分析時間            ~10.5小時

動手時間            ~4.5小時

輸入數(shù)量            0.1 - 1 ug總RNA或10 - 100 ng以前分離的mRNA(來自具有polyA尾的物種)

內(nèi)容規(guī)格            用鏈信息捕獲編碼轉(zhuǎn)錄組

行動機(jī)制            Oligo-dT珠子捕獲polyA尾巴

復(fù)                  1-96

描述                通過精確的鏈信息為研究人員提供清晰,全面的編碼轉(zhuǎn)錄組視圖。

專業(yè)樣品類型        不兼容FFPE

物種詳情            使用來自任何具有polyA尾巴的物種的高質(zhì)量RNA

系統(tǒng)兼容性          Genome Analyzer IIx,HiSeq 1000,HiSeq 1500,HiSeq 2000,HiSeq 2500,HiSeq 3000,HiSeq 4000,MiSeq,NextSeq 500,NextSeq 550,NovaSeq 6000

變體類              基因融合,新型轉(zhuǎn)錄本,單核苷酸多態(tài)性(SNPs),轉(zhuǎn)錄變體

物種類別            哺乳動物,大鼠,人類,牛,老鼠

核酸類型            RNA

技術(shù)                測序

方法                mRNA測序

線條特異性          擱淺

 

產(chǎn)品名稱:TruSeq Stranded mRNA文庫制備(48樣本)測序       產(chǎn)品貨號:20020594(ssv21106)

現(xiàn)貨供應(yīng),歡迎咨詢

歡迎您的致電  400  021  2200                    150  2101  0459

紅榮微再(上海)生物工程技術(shù)有限公司

 

產(chǎn)品介紹:TruSeq Stranded mRNA為編碼轉(zhuǎn)錄組分析提供了簡化,經(jīng)濟(jì)高效且可擴(kuò)展的解決方案。它與各種樣品兼容。

鋼絞線方向檢測

獲得mRNA鏈方向的精確測量,用于檢測反義轉(zhuǎn)錄,增強(qiáng)的轉(zhuǎn)錄物注釋和增加的比對效率。高覆蓋度均勻性增強(qiáng)了諸如替代轉(zhuǎn)錄物,基因融合和等位基因特異性表達(dá)等特征的發(fā)現(xiàn)。

成本效益

鏈狀信息識別來自給定RNA轉(zhuǎn)錄物的2條DNA鏈中的哪一條。該信息提供了對轉(zhuǎn)錄物注釋的增強(qiáng)的置信度,特別是對于非人類樣品。鑒定鏈來源增加了比對的讀數(shù)百分比,降低了每個樣品的測序成本。

可擴(kuò)展

該工作流程可以對標(biāo)準(zhǔn)樣品和低質(zhì)量樣品進(jìn)行可靠的詢問,并且工作流程與各種研究設(shè)計兼容。

 

更多產(chǎn)品,歡迎咨詢

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紅榮微再(上海)生物工程技術(shù)有限公司

                                     

文庫制備                              

品牌                  產(chǎn)品貨號          產(chǎn)品名稱

illumina品牌          20020594          TruSeq® Stranded mRNA Library Prep (48 Samples)文庫制備            

illumina品牌          20020595          TruSeq® Stranded mRNA Library Prep (96 Samples)文庫制備            

                                    

引物接頭                              

品牌                  產(chǎn)品貨號          產(chǎn)品名稱

illumina品牌          20020492          TruSeq® RNA Single Indexes Set A (12 Indexes, 48 Samples)引物接頭            

illumina品牌          20020493          TruSeq® RNA Single Indexes Set B (12 Indexes, 48 Samples)引物接頭            

illumina品牌          20019792          TruSeq RNA CD Index Plate (96 Indexes, 96 Samples)引物接頭            

illumina品牌          20020591          IDT for Illumina-TruSeq RNA UD Indexes (24 Indexes, 96 Samples)引物接頭            

illumina品牌          20022371          IDT for Illumina-TruSeq RNA UD Indexes (96 Indexes, 96 Samples)引物接頭            

 

配件產(chǎn)品                              

品牌                  產(chǎn)品貨號          產(chǎn)品名稱

illumina品牌          20024144          Illumina® Free Adapter Blocking Reagent (12 reactions)配件產(chǎn)品            

illumina品牌          20024145          Illumina® Free Adapter Blocking Reagent (48 reactions)配件產(chǎn)品      

 

文庫制備試劑盒                        

品牌                  產(chǎn)品貨號          產(chǎn)品名稱

illumina品牌          RS-122-2101        TruSeq Stranded mRNA Library Preparation Kit Set A (48 samples, 12 indexes)文庫制備試劑盒      

illumina品牌          RS-122-2102        TruSeq Stranded mRNA Library Preparation Kit Set B (48 samples, 12 indexes)文庫制備試劑盒      

illumina品牌          RS-122-2103        TruSeq Stranded mRNA Library Prep Kit High Throughput (96 samples, 96 indexes)文庫制備試劑盒    

 

Illumina二代測序技術(shù),邊合成邊測序(SBS),是廣泛采用的新一代測序(NGS)技術(shù),負(fù)責(zé)產(chǎn)生世界上90%以上的測序數(shù)據(jù)。

Illumina的二代測序技術(shù)稱為邊合成邊測序(Sequencing-by-Synthesis,簡稱SBS)。SBS主要包括堿基延伸、熒光激發(fā)及信號收集、剪切等3個步驟。這3個步驟可以重復(fù),循環(huán)進(jìn)行。每循環(huán)一次測定一個堿基。想測定多少個堿基(即讀長),就循環(huán)多少次。測序循環(huán)次數(shù)可以在軟件里設(shè)定。到底測序多長合適,要根據(jù)項目性質(zhì)和需求來決定。大多數(shù)情況下,SR實驗(單端測序)測定1x50個堿基,PE實驗(雙端測序)測定2x150個堿基。

1 堿基延伸

Illumina測序試劑里所使用的dNTP特色,它們同時具有兩個修飾基團(tuán):一個熒光基團(tuán),一個可逆終止基團(tuán)。A、G、C、T 4種堿基分別標(biāo)記4種不同的熒光基團(tuán),它們在不同波長的激光激發(fā)下,能夠發(fā)射不同波長(即顏色)的熒光。熒光顏色與堿基種類一一對應(yīng),因此根據(jù)激發(fā)光的波長可以識別堿基。4種堿基的終止基團(tuán)是一樣的。由于終止基團(tuán)的存在,所有dNTP每次都只能延伸1個堿基,無論給予多長的反應(yīng)時間。又由于該終止基團(tuán)是可逆的,在熒光信號收集完畢之后,可以用剪切劑切除該終止基團(tuán),使堿基恢復(fù)自然的可延伸狀態(tài),這時即可繼續(xù)進(jìn)行下一輪循環(huán),再測定一個堿基。

可逆終止基團(tuán)技術(shù)是Illumina二代測序的一大特色。它與橋式PCR技術(shù)一起,構(gòu)成了Illumina二代測序的兩大支柱,為穩(wěn)定獲得高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)打下了堅實的基礎(chǔ)。

2 信號采集

HiSeq系列測序儀具有紅綠兩根激光管,兩個濾色片。它們兩兩組合,可以形成4種不同的激發(fā)波長,正好分別用于激發(fā)A、G、C、T 4種堿基。

Cluster上所標(biāo)記的熒光基團(tuán)在激光激發(fā)下產(chǎn)生的信號,可以用相機(jī)拍攝或者掃描的方式收集信號。掃描技術(shù)速度比較快,被X10系列采用。由于FC面積比較大,而且上表面和下表面要分別拍照,所以拍照過程相當(dāng)耗時。對于經(jīng)典的HiSeq 2000來說,一次測序循環(huán)所產(chǎn)生的熒光信號,需要大約40分鐘的時間才能拍照收集完畢,時間比測序反應(yīng)本身還要長。

3 剪切

熒光信號收集完畢后,關(guān)閉激光,用剪切劑去除測序引物的延伸產(chǎn)物上的堿基所標(biāo)記的熒光基團(tuán)和終止基團(tuán)。兩個修飾基團(tuán)均被切除,一方面消去干擾熒光,一方面使鏈末端的堿基回復(fù)到自然的可延伸狀態(tài),為下一輪測序做好準(zhǔn)備。

再重復(fù)合成、激發(fā)、收集等步驟,即可進(jìn)行第二個堿基的測序。

測序循環(huán)可以重復(fù)多次。理論上可以一直重復(fù),直到信噪比降低得無法有效識別堿基信號為止。由于熒光基團(tuán)的發(fā)光效率持續(xù)不斷在衰減,Taq酶的活性也在持續(xù)不斷地衰減,所以實際上測序循環(huán)次數(shù)是有限的,大重復(fù)次數(shù)與sbs試劑的配方有關(guān)。測序的循環(huán)次數(shù)可以在軟件設(shè)置過程中人為,這個重復(fù)次數(shù)就是每個測序片段的讀長。目前,Illumina平臺的讀長有2x100 bp,2x125 bp,2x150 bp,2x300 bp等多種,其中2x150 bp用得較廣泛。

 

單端測序:單端測序(Single-read)首先將DNA樣本進(jìn)行片段化處理形成200-500bp的片段,引物序列連接到DNA片段的一端,然后末端加上接頭,將片段固定在flow cell上生成DNA簇,上機(jī)測序單端讀取序列。

 

雙端測序:雙端測序(Paired-end)方法是指在構(gòu)建待測DNA文庫時在兩端的接頭上都加上測序引物結(jié)合位點,在*輪測序完成后,去除*輪測序的模板鏈,用對讀測序模塊(Paired-End Module)引導(dǎo)互補(bǔ)鏈在原位置再生和擴(kuò)增,以達(dá)到第二輪測序所用的模板量,進(jìn)行第二輪互補(bǔ)鏈的合成測序。

 

基因測序是一種新型基因檢測技術(shù),能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預(yù)測罹患多種疾病的可能性,個體的行為特征及行為合理。基因測序技術(shù)能鎖定個人病變基因,提前預(yù)防和治療。

基因測序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實驗室研究演變到臨床使用,可以說基因測序技術(shù),是下一個改變世界的技術(shù) 。

基因測序只是基因檢測的方法之一,其又叫基因譜測序,是上*的一種基因檢測標(biāo)準(zhǔn)。

基因測序廣為人知的還有針對唐氏綜合征篩查的無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測。只需要采集孕婦的外周血,通過對血液中游離DNA(包括胎兒游離DNA)進(jìn)行測序,并將測序結(jié)果進(jìn)行生物學(xué)分析,從而得出胎兒是否患有染色體數(shù)目異常的疾病,包括常見的21-三體綜合征(唐氏綜合征)、18-三體綜合征(愛德華氏綜合征)和13-三體綜合征(Patau綜合征)。

 

附推廣:illumina品牌—RNA相關(guān)產(chǎn)品:

品牌                    產(chǎn)品貨號                產(chǎn)品名稱

illumina品牌        RS-200-1001        TruSeq RNA EPH Reagent Tube

illumina品牌        RS-303-1002        TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set A

illumina品牌        RS-303-1003        TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set B

illumina品牌        RS-304-1002        TruSight RNA Fusion Panel Set A (48 samples)

illumina品牌        RS-304-1003        TruSight RNA Fusion Panel Set B (48 samples)

illumina品牌        RT-101-1001        TruSeq Targeted RNA Custom Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-102-1001        TruSeq Targeted RNA Custom Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-201-1001        TruSeq Targeted RNA Neurodegeneration Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-201-1002        TruSeq Targeted RNA Hedgehog Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-201-1004        TruSeq Targeted RNA Wnt Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-201-1005        TruSeq Targeted RNA Stem Cell Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-201-1006        TruSeq Targeted RNA Cytochrome p450 Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-201-1007        TruSeq Targeted RNA p53 Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-201-1008        TruSeq Targeted RNA NFkB Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-201-1009        TruSeq Targeted RNA Cardiotoxicity Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-201-1010        TruSeq Targeted RNA Apoptosis Panel Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-202-1001        TruSeq Targeted RNA Neurodegeneration Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-202-1002        TruSeq Targeted RNA Hedgehog Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-202-1004        TruSeq Targeted RNA Wnt Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-202-1005        TruSeq Targeted RNA Stem Cell Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-202-1006        TruSeq Targeted RNA Cytochrome p450 Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-202-1007        TruSeq Targeted RNA p53 Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-202-1008        TruSeq Targeted RNA NFkB Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-202-1009        TruSeq Targeted RNA Cardiotoxicity Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-202-1010        TruSeq Targeted RNA Apoptosis Panel Kit (96 samples)

illumina品牌        RT-801-1001        TruSeq Targeted RNA Supplemental Content Kit (48 samples)

illumina品牌        RT-802-1001        TruSeq Targeted RNA Supplemental Content Kit (96 samples)

illumina品牌        RZE1224            Ribo-Zero? rRNA Removal Regents (Epidemiology) 24 Reactions

illumina品牌        RZH110424          Ribo-Zero? rRNARemoval Kit (H/M/R) 24rxns

illumina品牌        RZHM11106          Ribo-ZeroTM Gold rRNA Removal Reagents (Human/Mouse/Rat)

illumina品牌        RZMB12324          Ribo-Zero? rRNA Removal Reagents (Bacteria) 24 Reactions

illumina品牌        RZNB1056          Ribo-Zero rRNA-Removal Reagents (Gram-Negative Bacteria) 6 Rxns

illumina品牌        RZPL11016          Ribo-Zero rRNA Removal Reagents (Plant Leaf) 6 Rxns

illumina品牌        RZSR11036          Ribo-Zero rRNA Removal Reagents (Plant Seed/Root) 6 Rxns

illumina品牌        T4RL2DML-X        T4 RNA Ligase 2, Deltion Mutant-Bulk

illumina品牌        T7R100UML-X        T7 RNA Polymerase (100 U/ul)-Bulk

illumina品牌        T7R1KUML-X        T7 RNA Polymerase-Bulk; 1,000 U/ul

illumina品牌        T7R50UML-X        T7 RNA Polymerase (50 U/ul) - Bulk

illumina品牌        TAB1R80524        TargetAmp 1-Round Biotin-aRNA Amplification Kit 105 24 Rxns

 

產(chǎn)品名稱:TruSeq Stranded mRNA文庫制備(48樣本)測序       產(chǎn)品貨號:20020594(ssv21106)

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