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產(chǎn)品中心

BD Rhapsody 單細(xì)胞分析系統(tǒng),RNA轉(zhuǎn)錄組分析

  • 型   號(hào):
  • 價(jià)   格:1500000

BD Rhapsody 單細(xì)胞分析系統(tǒng),RNA轉(zhuǎn)錄組分析:
捕獲并分離細(xì)胞,通過(guò)磁珠對(duì)細(xì)胞和mRNA轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行分類
分子標(biāo)簽可以克服PCR偏差
可以定制靶向組合(panel)
提供數(shù)據(jù)分析工具

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產(chǎn)品英文名:BD RhapsodyTM Single-Cell Analysis System

產(chǎn)品中文名:BD RhapsodyTM 單細(xì)胞分析系統(tǒng)

 

應(yīng)用:?jiǎn)渭?xì)胞的RNA-seq測(cè)序,基因表達(dá)分析。Onco-BC 靶向檢測(cè),免疫反應(yīng)檢測(cè),T-細(xì)胞靶向檢測(cè)。

優(yōu)勢(shì):同時(shí)分析數(shù)千個(gè)細(xì)胞,每個(gè)細(xì)胞提取獨(dú)立數(shù)據(jù),體現(xiàn)異質(zhì)性。

品牌產(chǎn)地:美國(guó)BD

 

BD RhapsodyTM 單細(xì)胞分析系統(tǒng)及更多BD產(chǎn)品由華雅再生醫(yī)學(xué)旗艦公司:紅榮微再(上海)生物工程技術(shù)有限公司 代理。紅榮微再“傳遞科學(xué)價(jià)值,服務(wù)科學(xué)研究”為宗旨主營(yíng)干細(xì)胞、精準(zhǔn)醫(yī)療、細(xì)胞治療、器官再生四大板塊的產(chǎn)品

  :1500 1904 520。紅榮微再-客服:  經(jīng)銷商專員

 

BD RhapsodyTM 單細(xì)胞分析系統(tǒng)

 

數(shù)千個(gè)單細(xì)胞數(shù)百個(gè)基因的平行分析

單細(xì)胞 RNAseq 正在改變我們對(duì)細(xì)胞的理解。BDRhapsody™單細(xì)胞分析系統(tǒng)基于 BD 在細(xì)胞生物學(xué)領(lǐng)域 40年的專業(yè)技術(shù),滿足您的實(shí)驗(yàn)需求,在單細(xì)胞水平理解細(xì)胞形態(tài)和功能。

 

這種全新的分析系統(tǒng)克服了傳統(tǒng)檢測(cè)的局限性,例如微陣列和大量細(xì)胞 RNAseq,這些檢測(cè)通過(guò)實(shí)現(xiàn)對(duì)各個(gè)細(xì)胞之間的微妙差異的觀察,依賴于對(duì)多個(gè)細(xì)胞的平均檢測(cè)。用戶可以鑒定和表征新型和罕見細(xì)胞類型,其進(jìn)一步幫助理解從免疫學(xué)到腫瘤學(xué)等多個(gè)領(lǐng)域內(nèi)的生物學(xué)過(guò)程。

 

BD Rhapsody 單細(xì)胞分析系統(tǒng)能夠?qū)Τ汕先f(wàn)個(gè)單細(xì)胞的數(shù)百個(gè)表達(dá)基因進(jìn)行數(shù)字定量,提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿足任何實(shí)驗(yàn)需要,其有效系統(tǒng)可縮短實(shí)驗(yàn)時(shí)間和降低測(cè)序成本。

 

系統(tǒng)組件包括:

 BD Rhapsody 掃描儀

 BD Rhapsody 上樣臺(tái)

 BD Rhapsody 卡式芯片

 分子標(biāo)簽試劑和文庫(kù)制備

 特定應(yīng)用的靶向檢測(cè)試劑盒(panel)

 

BD Rhapsody 單細(xì)胞分析系統(tǒng)工作原理

 

下圖顯示了該系統(tǒng)如何實(shí)現(xiàn)對(duì)數(shù)百個(gè)基因的基因表達(dá)水平進(jìn)行數(shù)字化定量。其采用新的平面陣列微孔用于細(xì)胞捕獲并進(jìn)行基于微球的 3'RNAseq 測(cè)定。

 

 

 

開始 - 細(xì)胞捕獲和分離步驟

BD Rhapsody 卡式芯片可以在磁性的寡核苷酸條形碼標(biāo)記微球上實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞捕獲和 mRNA 轉(zhuǎn)錄子的分子標(biāo)簽。然后將這些微球合并到單個(gè)管中用于 cDNA 擴(kuò)增和文庫(kù)構(gòu)建。

1.在微孔中,一個(gè)細(xì)胞與一個(gè)條碼標(biāo)記微球匹配

2.裂解細(xì)胞將 mRNA與微球上條碼標(biāo)記的捕獲寡核苷酸雜交

3. 微球回收

4. cDNA 合成

5. 測(cè)序和構(gòu)建單細(xì)胞基因表達(dá)譜

 

克服 PCR 偏差 – BD 分子標(biāo)簽

當(dāng)對(duì)序列讀取進(jìn)行計(jì)數(shù)時(shí),PCR 擴(kuò)增偏差可導(dǎo)致基因定量不準(zhǔn)確。BD 的分子標(biāo)簽技術(shù)為單個(gè)細(xì)胞的單個(gè)基因分配了*的分子索引,也稱為“分子條形碼”。實(shí)驗(yàn)者可借此克服擴(kuò)增偏差,更準(zhǔn)確地計(jì)算轉(zhuǎn)錄水平

 

 

為您的實(shí)驗(yàn)定制工作流程

對(duì)于不同用戶和實(shí)驗(yàn),單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)工作流程往往需要不同程度的樣本操作、質(zhì)量和通量。BD 儀器選項(xiàng)可以根據(jù)具體需求進(jìn)行配置。BD FACS 分選機(jī)(如 BD FACSMelody™)是 BD Rhapsody 系統(tǒng)上游樣本富集的良好選擇。BD Rhapsody掃描儀提供自動(dòng)化細(xì)胞計(jì)數(shù)和細(xì)胞樣本活性測(cè)試,幫助用戶制備適用于卡式芯片單細(xì)胞捕獲的*濃度的樣本。掃描儀提供了卡式芯片上微球捕獲細(xì)胞的計(jì)數(shù)。BD Rhapsody 上樣臺(tái)輕巧便攜,可在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)輕松移動(dòng)。同樣還提供生物信息學(xué)途徑和可視化工具。這些工具包括 UMI 分析算法和可視化工具,即使沒有經(jīng)驗(yàn)的用戶也可分析和理解單細(xì)胞數(shù)據(jù)。

 

 

圖. 實(shí)例:BD Rhapsody 工作流程,包括細(xì)胞分離(FACS 可選),細(xì)胞捕獲和分子標(biāo)簽、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析。

1. 樣本

2. 通過(guò) BD Rhapsody 進(jìn)行單細(xì)胞

3. 在 Illumina 平臺(tái)上進(jìn)行測(cè)序

4. BD 基因組數(shù)據(jù)分析

 

更有效的測(cè)序可以更低的成本實(shí)現(xiàn)更高的通量

由于與高通量實(shí)驗(yàn)方法相關(guān)的測(cè)序成本,單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)往往非常昂貴。BD Rhapsody 單細(xì)胞分析系統(tǒng)設(shè)計(jì)有多個(gè)功能,可以更有效地利用測(cè)序來(lái)降低實(shí)驗(yàn)成本。

靶向測(cè)定 - 由于檢測(cè)靈敏度的提高,特定的基因組合方法可使用少量的時(shí)間和成本,幫助產(chǎn)生類似于全轉(zhuǎn)錄組分析(Whole Transcriptome Analysis,WTA)測(cè)定的結(jié)果。這種方法還提高了 UMI 計(jì)數(shù)效率,從而極大程度的節(jié)省了實(shí)驗(yàn)時(shí)間和成本。

儲(chǔ)存 - 從樣本中得到的完整 cDNA 可在磁性微球上穩(wěn)定存儲(chǔ),允許將珍貴樣本保存長(zhǎng)達(dá) 16 周。這可使用戶在時(shí)間允許的情況下靈活地對(duì)樣本進(jìn)行測(cè)序,并通過(guò)對(duì)儲(chǔ)存的微球池進(jìn)行等分或分樣來(lái)實(shí)現(xiàn)同一樣本的多個(gè)測(cè)定。

分樣—在磁性微球上儲(chǔ)存的 cDNA A 可以分成一個(gè)或多個(gè)等分試樣,并使用定制或預(yù)先設(shè)計(jì)的組合(panel)進(jìn)行擴(kuò)增。通過(guò)提供對(duì)部分樣本進(jìn)行測(cè)序的選項(xiàng)和對(duì)樣本不同組合(panel)進(jìn)行測(cè)試的靈活性,分樣可降低成本。

 

評(píng)估 BD Rhapsody 的性能

為了確定 BD Rhapsody 單細(xì)胞分析系統(tǒng)的技術(shù)性能,將人 293T 和小鼠 NIH / 3T3 細(xì)胞的 1:1 混合物以不同濃度上樣到 BD Rhapsody 卡式芯片上。儲(chǔ)存的 cDNA 分子普遍擴(kuò)增并進(jìn)行低通量測(cè)序(每個(gè)細(xì)胞約8,700 個(gè)讀數(shù))。在測(cè)序數(shù)據(jù)中檢測(cè)到 1,109 個(gè)細(xì)胞的上樣條件下,每個(gè)細(xì)胞中,來(lái)自每個(gè)細(xì)胞的平均 99.4%的分子經(jīng)檢測(cè)僅為人或小鼠,這表明微孔之間的串?dāng)_非常小。在測(cè)序數(shù)據(jù)中檢測(cè)到 1,000 個(gè)或更少細(xì)胞的上樣密度下,多重態(tài)發(fā)生率接近零,并且在 15,000 個(gè)細(xì)胞下小于 5%。

 

圖:使用 BD Rhapsody 的微孔之間的zui小串?dāng)_和低多重態(tài)率

 

 

 

 

使單細(xì)胞測(cè)序效率更高

 

靶向方法對(duì)單細(xì)胞分析的益處通過(guò)使用競(jìng)爭(zhēng)產(chǎn)品的WTA 測(cè)定和 BD Rhapsody 免疫反應(yīng)組合(panel)(人)在相似的測(cè)序深度下對(duì)外周血單核細(xì)胞(PBMC)進(jìn)行表達(dá)譜分析來(lái)證明。雖然兩種測(cè)定方法的 t-SNE 表達(dá)譜分析都顯示了已知 PMBC 細(xì)胞類型的聚類結(jié)果,靶向組合(panel)顯示了比 WTA 更高的靈敏度(讀數(shù)/細(xì)胞)和 UMI 計(jì)數(shù)效率。BD Rhapsody 測(cè)定實(shí)現(xiàn)了與競(jìng)品 WTA 測(cè)定類似的聚類性能,而測(cè)序讀數(shù)降低了近 10 倍(靶向讀數(shù) 2k vs. WTA 讀數(shù) 20k)。與使用 WTA 方法不同,靶向組合(panel)避免了對(duì)多個(gè)高表達(dá)基因的測(cè)序如核糖體蛋白或低表達(dá)變異性,從而提高測(cè)定效率。

 

混合微球的測(cè)試儲(chǔ)存(參見圖),從含有稀少轉(zhuǎn)移性乳腺癌細(xì)胞的淋巴結(jié)所得的 1,000 個(gè)細(xì)胞的兩個(gè)分樣使用BD Rhapsody Onco-BC 靶向組合(panel)進(jìn)行分析。在 4℃下保存微球,在 0、6 和 12 周對(duì)樣本進(jìn)行測(cè)定。在分樣之間基因表達(dá)具有很強(qiáng)的相關(guān)性,表明儲(chǔ)存 cDNA 具有極小的批次效應(yīng)和較高的穩(wěn)定性。

 

 

 

主要應(yīng)用的靶向基因檢測(cè)試劑盒(panel)

 

靶向方法有助于提高單細(xì)胞測(cè)序效率,并推動(dòng)對(duì)當(dāng)今一些挑戰(zhàn)性的科學(xué)領(lǐng)域的進(jìn)一步探索。我們經(jīng)驗(yàn)證的檢測(cè)試劑盒(panel)顯示穩(wěn)定且可重現(xiàn)的細(xì)胞異質(zhì)性陣列,可用于探索與眾多應(yīng)用相關(guān)的細(xì)胞類型。BD Rhapsody 系統(tǒng)包括以下檢測(cè)試劑盒(panel):

● BD Rhapsody Onco-BC 靶向檢測(cè)試劑盒(panel) – 與乳腺癌和免疫細(xì)胞相關(guān)的 400 個(gè)基因

● BD Rhapsody 免疫反應(yīng)檢測(cè)試劑盒(panel) – 免疫細(xì)胞類型譜分析

● BD Rhapsody T-細(xì)胞靶向檢測(cè)試劑盒(panel)

● BD Rhapsody 補(bǔ)充檢測(cè)試劑盒(panel)

● BD Rhapsody 自定義檢測(cè)試劑盒(panel)

 

高級(jí)軟件和可視化功能增加您結(jié)果的靈活性

BD Rhapsody 系統(tǒng)還提供生物信息學(xué)途徑和可視化工具。這些工具包括 UMI 分析算法和可視化工具,即使沒有經(jīng)驗(yàn)的用戶也能夠分析和理解單細(xì)胞數(shù)據(jù)。

 

1. 序列發(fā)生器輸出.fastq 文件

  • 多路分用 讀數(shù);調(diào)準(zhǔn)讀數(shù)
  • 計(jì)算每個(gè)細(xì)胞每個(gè)基因的*分子標(biāo)識(shí)符(UMI)
  • 執(zhí)行 UMI 調(diào)整算法
  • 進(jìn)行細(xì)胞標(biāo)記篩選
  • 單細(xì)胞表達(dá)譜

 

BD Rhapsody 系統(tǒng)數(shù)據(jù)集可從 www.xxxxx。。com 下載

實(shí)例數(shù)據(jù)集:

 來(lái)自健康捐贈(zèng)者的 PMBC 的單細(xì)胞譜分析

 T 細(xì)胞表型分析

 乳腺癌腫瘤活檢的單細(xì)胞譜分析

 

單細(xì)胞研究的完整端到端系統(tǒng)

BD Rhapsody 單細(xì)胞分析系統(tǒng)通過(guò)完整的工具系統(tǒng)(包括試劑和分析軟件)來(lái)加強(qiáng)和簡(jiǎn)化您的研究,這些工具可以協(xié)同工作,以滿足您*的單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)需求。我們將使您直接通過(guò)樣本獲取結(jié)果,同時(shí)使用實(shí)驗(yàn)成本和復(fù)雜性顯著降低的測(cè)定方法節(jié)省時(shí)間和成本,改善數(shù)據(jù)和提高測(cè)序效率。40 年來(lái),BD 一直是單細(xì)胞生物學(xué)領(lǐng)域值得信賴的合作伙伴。您可以依靠我們來(lái)幫助您拓展單細(xì)胞分析的新領(lǐng)域。

 

BD RhapsodyTM 單細(xì)胞分析系統(tǒng)及更多BD產(chǎn)品由華雅再生醫(yī)學(xué)旗艦公司:紅榮微再(上海)生物工程技術(shù)有限公司 代理。紅榮微再“傳遞科學(xué)價(jià)值,服務(wù)科學(xué)研究”為宗旨主營(yíng)干細(xì)胞、精準(zhǔn)醫(yī)療、細(xì)胞治療、器官再生四大板塊的產(chǎn)品。

  :1500 1904 520。紅榮微再-客服:   經(jīng)銷商專員

 

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