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KAPA hgDNA定量及QC試劑盒
產(chǎn)品名稱:KAPA hgDNA定量及QC試劑盒產(chǎn)品貨號:KK4960產(chǎn)品規(guī)格:300反應(yīng)
產(chǎn)品介紹:
KAPA hgDNA定量&QC試劑盒,包含人類基因組DNA樣品NGS文庫構(gòu)建前,所有基于qPCR定量及質(zhì)量評估的試劑。
KAPA hgDNA定量&QC試劑盒,是基于SYBR Green I染料法優(yōu)化的高質(zhì)量qPCR檢測試劑盒,包含KAPA SYBR® FAST qPCR Master Mix預(yù)先稀釋的一系列DNA標(biāo)準(zhǔn)品,以及針對于人類基因組單拷貝的高度保守區(qū)域的不同位點(diǎn)所設(shè)計(jì)的引物預(yù)混液。最小片段所對應(yīng)的引物,用于獲得絕對定量的結(jié)果,而額外的引物,用于獲得在DNA樣本中可擴(kuò)增模板量(質(zhì)量高的核酸片段)的信息。這個試劑盒由此所產(chǎn)生的質(zhì)量分?jǐn)?shù)(即Q-ratios),可以用于預(yù)測文庫的產(chǎn)量,或者對于如FFPE DNA這類樣本質(zhì)量變化很大的樣本的工作流程進(jìn)行調(diào)整。
產(chǎn)品名稱:KAPA hgDNA定量及QC試劑盒
產(chǎn)品貨號:KK4960
產(chǎn)品特點(diǎn):
在單次檢測中,同時評估樣本量以及樣本質(zhì)量
可以將質(zhì)量分?jǐn)?shù)(Q-ratios)與測序相關(guān)指標(biāo)相關(guān)聯(lián)
高性能的KAPA SYBR FAST qPCR Master Mix
預(yù)先稀釋好的DNA標(biāo)準(zhǔn)品以及可以直接使用的引物
多功能、易于自動化的工作流程
產(chǎn)品原理:
一組DNA標(biāo)準(zhǔn)品,使用三對不同引物,用于產(chǎn)生(最多)三組標(biāo)準(zhǔn)曲線。這三對引物的擴(kuò)增目標(biāo),位于某高度保守、單拷貝的人類基因組位點(diǎn),其大小分別為41 bp, 129 bp以及305 bp。41 bp檢測用于DNA樣品的絕對定量。對于評估DNA質(zhì)量,使用129 bp和/或305 bp引物預(yù)混液生成標(biāo)準(zhǔn)曲線并且檢測樣本。由于低質(zhì)量的DNA樣本的長片段擴(kuò)增效率會大幅度降低,相對的DNA質(zhì)量可以通過41 bp檢測的濃度,對于129 bp或者305 bp檢測的濃度進(jìn)行均一化,或者在此DNA樣本中可被擴(kuò)增的物質(zhì)的量來進(jìn)行推測。這種通過標(biāo)準(zhǔn)化產(chǎn)生的質(zhì)量分?jǐn)?shù)(值介于0和1之間),可以用于指示DNA的質(zhì)量,或者在此DNA樣本中可被擴(kuò)增的物質(zhì)的量。
產(chǎn)品優(yōu)勢:
指示樣品是否有足夠的量以及質(zhì)量來成功構(gòu)建文庫
未通過質(zhì)控的樣本,不再進(jìn)行后續(xù)文庫構(gòu)建以及測序步驟,從而節(jié)約時間和精力
使用預(yù)期:
Q129/41 比值和測序中的關(guān)鍵指標(biāo)(如重復(fù)率)具有相關(guān)性
從250 ng Covaris打斷的FFPE DNA樣本(n=14)和對照組DNA(分別從培養(yǎng)細(xì)胞、新鮮冰凍樣本和血液中提取,n=6),進(jìn)行手動文庫構(gòu)建。樣本按照Q129/41-比例升序在x軸上從左至右排列(FFPE樣本用黃色表示,對照組DNA用橙色表示)。文庫構(gòu)建采用的是NEBNext® 試劑(New England Biolabs),其中靶標(biāo)捕獲前和靶標(biāo)捕獲后的擴(kuò)增環(huán)節(jié)(10個循環(huán))采取KAPA HiFi 試劑盒。靶標(biāo)捕獲使用的是定制的SeqCap EZ panel (300 genes,0.9 MB)。 在Illumina HiSeq平臺上進(jìn)行了測序(2 x 100 bp)。FFPE樣本的平均靶標(biāo)覆蓋率(藍(lán)色點(diǎn))是對照組的四倍(1,247X, vs. 301X),平均重復(fù)率(紅色點(diǎn))是對照組的兩倍(75% vs. 38%)。Q129/41 比值 > 0.4 的FFPE樣本所產(chǎn)出的文庫能夠達(dá)到測序質(zhì)量要求。
產(chǎn)品訂購信息
產(chǎn)品名稱:KAPA hgDNA定量及QC試劑盒
產(chǎn)品貨號:KK4960
關(guān)于公司:
Kapa Biosystems位于美國馬薩諸塞州威爾明頓,是一家蛋白質(zhì)工程專家及基因組學(xué)工具供應(yīng)商,致力于研發(fā)、生產(chǎn)下一代測序(NGS)所需的生物酶及相關(guān)試劑,該公司基于直接分子進(jìn)化平臺開發(fā)的產(chǎn)品已被廣泛用于DNA擴(kuò)增、測序、基因組學(xué)研究、分子診斷等領(lǐng)域。
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紅榮微再作為RNA、NGS、ctDNA、qPCR的分子診斷專業(yè)供應(yīng)商,以“傳遞科學(xué)價值,服務(wù)科學(xué)研究"為宗旨,努力為客戶提供質(zhì)量可靠、貨美價優(yōu)的分子診斷試劑耗材,與客戶攜手為中國分子診斷的發(fā)展而前行。